Nakita namin ang nakakatakot na Xenomorph na gumagapang sa uniberso ng Marvel sa kakaibang okasyon sa nakaraan, tulad ng dati nang makita ng Alien vs. Avengers kung ano ang nangyari nang ang Earth's Mightiest Heroes ay kailangang labanan ito sa perpektong organismo. Ngayon ay dumating na ang oras para sa mga Anak ng Atom, ang mga mutants, upang ihagis ang mga nakakatakot na cosmic species.
Inihayag ng Marvel ang Alien vs. X-Men, na halos eksakto kung ano ang maaari mong isipin. Nakikita ng balangkas ang mga X-Men na patungo sa kalawakan sa pangangaso para sa isang itlog ng Phoenix para lamang tumakbo sa Xenomorphs. Mula rito, ang tanong ay kung sino ang makakaligtas kapag inilalaban ang pangwakas na species laban sa kasalukuyang pinaka-umunlad na anyo ng sangkatauhan.
Ang balangkas para sa komiks crossover ay ipinaliwanag tulad nito: "Ang X-Men ay nagpunta sa paghahanap ng isang itlog ng Phoenix. May natagpuan silang iba. Ang mga X-Men ay bumalik sa Earth na may nakamamatay na kargamento, at nagsimula ang marahas na labanan sa pagitan ng mutant at alien. Ang isang hindi inaasahang kaalyado ba ay magbabago sa pabor ng X-Men? May makakaligtas ba sa karanasan? Nagsisimula na ang susunod na ebolusyon ng pinakamakapangyarihang mutants ng Marvel! Dagdag pa: Ang isang batang Kitty Pryde ay nahaharap sa kanyang pinakadakilang bangungot kapag siya ay hinabol ng dalawa sa mga pinakadakilang takot sa kalawakan: ang Brood at ang Xenomorphs!
Isinulat ni Kieron Gillen at may sining mula kay Geraldo Borges, ang Alien vs. X-Men ay itinuturing na isang "saga", na mag-aalok din ng karagdagang salaysay sa anyo ng isang apat na bahagi na kuwento ng bonus mula sa tagalikha ng X-Men na si Chris Claremont. Ang unang isyu ng comic run ay darating sa Setyembre 16 at makikita mo ang pabalat nito, tulad ng inilarawan ni Ryan Stegman, sa ibaba.
